Parcours 13
NONMEM
Le standard historique : control stream, blocs $PK/$ERROR, FOCE-I et le dossier réglementaire.
Prérequis
Les algorithmes d'estimation : FOCE et SAEMCours et activités
- 01
NONMEM — l'ancêtre
Le logiciel historique de la pharmacométrie : fichiers de contrôle, FOCE, et statut réglementaire.
- Préparer un ajustement NONMEM10 min · À commencer
- 02
NONMEM — le modèle structural
Le control stream bloc par bloc : les ADVAN pré-programmés contre un système d'EDO écrit à la main, le choix du TRANS, et la mise à l'échelle.
- NONMEM : vérifier les échelles10 min · À commencer
- 03
NONMEM — ETA, OMEGA et variabilité
Comment NONMEM code la variabilité : les ETA log-normaux, les blocs OMEGA diagonaux ou pleins, l'IOV par etas répétés, et la lecture du shrinkage.
- NONMEM : traduire OMEGA10 min · À commencer
- 04
NONMEM — le bloc ERROR et les données sous la LOQ
Écrire le bloc ERROR : additive, proportionnelle, combinée ; régler SIGMA, traiter les données censurées (M1-M7) et lire WRES, CWRES et IWRES.
- NONMEM : coder 20 % d’erreur10 min · À commencer
- 05
Le moteur de NONMEM — FOCE-I décortiqué
Ce que calcule vraiment la ligne ESTIMATION : linéarisation de Taylor autour des EBE, rôle de INTER, nature de l'OFV et lecture des statuts de terminaison.
- NONMEM : contrôler la stabilité10 min · À commencer
- 06
NONMEM — pour aller plus loin
Distributions logit et normale, information a priori, MU-referencing, écosystème PsN/Xpose/Pirana et simulation.
- NONMEM : un bootstrap par patient10 min · À commencer
Mise en pratique
Cas en plusieurs étapes combinant calcul, interprétation et raisonnement.
Préparer un ajustement NONMEM
Calcul · InterprétationÀ commencer
Préparer un ajustement NONMEM
Calcul · InterprétationÀ commencerCas en plusieurs étapes combinant calcul, interprétation et raisonnement.
NONMEM : vérifier les échelles
Calcul · Interprétation · Lecture de codeÀ commencer
NONMEM : vérifier les échelles
Calcul · Interprétation · Lecture de codeÀ commencerCas en plusieurs étapes combinant calcul, interprétation et raisonnement.
NONMEM : traduire OMEGA
Calcul · Interprétation · Lecture de codeÀ commencer
NONMEM : traduire OMEGA
Calcul · Interprétation · Lecture de codeÀ commencerCas en plusieurs étapes combinant calcul, interprétation et raisonnement.
NONMEM : coder 20 % d’erreur
Calcul · Interprétation · Lecture de codeÀ commencer
NONMEM : coder 20 % d’erreur
Calcul · Interprétation · Lecture de codeÀ commencerCas en plusieurs étapes combinant calcul, interprétation et raisonnement.
NONMEM : contrôler la stabilité
Calcul · Décision · InterprétationÀ commencer
NONMEM : contrôler la stabilité
Calcul · Décision · InterprétationÀ commencerCas en plusieurs étapes combinant calcul, interprétation et raisonnement.