Parcours 14
Monolix
Le workflow graphique : le langage mlxtran, le moteur SAEM et les diagnostics intégrés.
Prérequis
Les algorithmes d'estimation : FOCE et SAEMCours et activités
- 01
Monolix — interface, mlxtran & SAEM
Le logiciel « au clic » : interface graphique, langage mlxtran et moteur SAEM avec diagnostics intégrés.
- Préparer un ajustement Monolix10 min · À commencer
- 02
Monolix — le modèle structural en mlxtran
Le bloc [LONGITUDINAL] : bibliothèque pkmodel() ou EDO écrites à la main, conditions initiales, t0 et routage de la dose.
- Monolix : vérifier les échelles10 min · À commencer
- 03
Monolix — le bloc INDIVIDUAL, omega et covariables
Le modèle statistique en mlxtran : distributions logNormal, normal et logitNormal, corrélations entre effets aléatoires, IOV par niveau de variabilité, covariables et lecture du shrinkage.
- Monolix : traduire OMEGA10 min · À commencer
- 04
Monolix — le modèle d'erreur résiduelle et la censure
Le bloc DEFINITION : errorModel constant, proportional, combined1 et combined2, le rôle de distribution, la censure BLQ native et la lecture des IWRES.
- Monolix : coder 20 % d’erreur10 min · À commencer
- 05
Monolix — le moteur SAEM
Pourquoi une approximation stochastique de l'EM plutôt qu'une linéarisation : les deux phases, la vraisemblance calculée à part, et ce que convergence veut dire ici.
- Monolix : contrôler la stabilité10 min · À commencer
- 06
Monolix — pour aller plus loin
Distributions bornées logit et probit, auto-initialisation, tests automatiques de covariables, MonolixSuite et export NONMEM.
- Monolix : un bootstrap par patient10 min · À commencer
Mise en pratique
Cas en plusieurs étapes combinant calcul, interprétation et raisonnement.
Préparer un ajustement Monolix
Calcul · InterprétationÀ commencer
Préparer un ajustement Monolix
Calcul · InterprétationÀ commencerCas en plusieurs étapes combinant calcul, interprétation et raisonnement.
Monolix : vérifier les échelles
Calcul · Interprétation · Lecture de codeÀ commencer
Monolix : vérifier les échelles
Calcul · Interprétation · Lecture de codeÀ commencerCas en plusieurs étapes combinant calcul, interprétation et raisonnement.
Monolix : traduire OMEGA
Calcul · Interprétation · Lecture de codeÀ commencer
Monolix : traduire OMEGA
Calcul · Interprétation · Lecture de codeÀ commencerCas en plusieurs étapes combinant calcul, interprétation et raisonnement.
Monolix : coder 20 % d’erreur
Calcul · Interprétation · Lecture de codeÀ commencer
Monolix : coder 20 % d’erreur
Calcul · Interprétation · Lecture de codeÀ commencerCas en plusieurs étapes combinant calcul, interprétation et raisonnement.
Monolix : contrôler la stabilité
Calcul · Décision · InterprétationÀ commencer
Monolix : contrôler la stabilité
Calcul · Décision · InterprétationÀ commencerCas en plusieurs étapes combinant calcul, interprétation et raisonnement.