nlmixr2

Cours et activités

1. 01

   nlmixr2 — l'open source (R)

   Estimer en R avec plusieurs familles d'estimateurs, le moteur rxode2 et l'écosystème R.

   11 min · À consulter
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   • Préparer un ajustement nlmixr210 min · À commencer
2. 02

   nlmixr2 — le modèle structural en R

   La fonction R à deux blocs : ini({}) pour les nombres, model({}) pour les équations, EDO ou linCmt(), et la ligne cp ~ pour l'observation.

   10 min · À consulter
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   • nlmixr2 : vérifier les échelles10 min · À commencer
3. 03

   nlmixr2 — ini, model et la variabilité

   Le modèle statistique en R : le tilde qui déclare un eta, la convention log-transformée des theta, les blocs de covariance, l'IOV par niveau, les covariables et la lecture de fit$omega et fit$shrink.

   13 min · À consulter
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   • nlmixr2 : traduire OMEGA10 min · À commencer
4. 04

   nlmixr2 — le modèle d'erreur résiduelle et le BLQ

   Déclarer l'erreur dans model() : add, prop, pow, lnorm et leurs combinaisons ; les valeurs initiales dans ini(), le BLQ par les colonnes CENS et LIMIT, les diagnostics ggPMX et xpose.nlmixr2.

   12 min · À consulter
   CoursExercices
   • nlmixr2 : coder 20 % d’erreur10 min · À commencer
5. 05

   nlmixr2 — un modèle, plusieurs estimateurs

   est = focei, saem, nlme ou posthoc : changer d'algorithme sans toucher au modèle, ce que rxode2 compile derrière, et les conditions nécessaires pour comparer les OFV rendus.

   10 min · À consulter
   CoursExercices
   • nlmixr2 : contrôler la stabilité10 min · À commencer
6. 06

   nlmixr2 — pour aller plus loin

   Paramètres bornés avec expit et probitInv, auto-initialisation par NCA, boucler sur des modèles en R, babelmixr2 et la simulation rxode2.

   10 min · À consulter
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   • nlmixr2 : un bootstrap par patient10 min · À commencer