NONMEM — l'ancêtre

Racym Berrah, PharmD PMx Explain Relecture scientifique par l'auteur : 2026-10-12 ORCID

Le logiciel historique de la pharmacométrie : fichiers de contrôle, FOCE, et statut réglementaire.

01 · Pourquoi ce chapitre

NONMEM (NONlinear Mixed-Effects Modeling) est le logiciel fondateur de la pharmacométrie, créé par Beal & Sheiner à la fin des années 1970. Il reste très largement utilisé dans les soumissions réglementaires : beaucoup de dossiers d'AMM reposent sur lui.

Austère mais éprouvé, il impose une façon de penser que tout pharmacométricien connaît.

02 · Intuition

Pas d'interface graphique : on écrit un fichier de contrôle (control stream) qui décrit les données, le modèle et la méthode. Un préprocesseur (NM-TRAN) le traduit en Fortran, puis NONMEM minimise l'OFV.

Tout est explicite — d'où une grande maîtrise, au prix d'une courbe d'apprentissage.

03 · La formule décortiquée

Un control stream s'organise en blocs ($), par exemple :

$PROBLEM  Warfarine 1-cpt
$DATA     warfarin.csv IGNORE=@
$INPUT    ID TIME AMT DV
$SUBROUTINE ADVAN2 TRANS2      ; 1-cpt, absorption d'ordre 1
$PK       CL = THETA(1)*EXP(ETA(1))
          V  = THETA(2)*EXP(ETA(2))
          KA = THETA(3)
$ERROR    Y = F + F*EPS(1)     ; erreur proportionnelle
$THETA    (0,0.13) (0,8) (0,1)
$OMEGA    0.1 0.1
$SIGMA    0.05
$ESTIMATION METHOD=1 INTER     ; FOCE avec interaction

METHOD=1 INTER = FOCE-I ; NONMEM propose aussi SAEM et l'échantillonnage d'importance (IMP).

04 · Exemple concret

Pour une soumission réglementaire, un modèle NONMEM (control stream + tables de sortie) est très souvent utilisé et facilement relu par les équipes spécialisées. Ce n'est pas un format exigé par la FDA ou l'EMA, mais sa robustesse et son historique en font un standard de fait dans de nombreux dossiers.

Autour de lui, des outils R (Xpose, PsN) gèrent les diagnostics, les bootstraps et les VPC.

05 · Piège fréquent

La rigueur du fichier de contrôle est un piège pour débutants.

06 · À retenir

NONMEM : le logiciel fondateur (Beal & Sheiner), très largement utilisé dans les dossiers réglementaires sans être exigé comme format par les agences.
Usage par fichier de contrôle (blocs $), prétraité par NM-TRAN ; méthode historique FOCE-I.
Écosystème R autour (Xpose, PsN, Pirana) pour diagnostics et bootstraps.
Puissant et éprouvé, mais austère ; attention aux erreurs de données et à la non-convergence.

Point de contrôle

Vérifiez votre compréhension

Q1. NONMEM s'utilise principalement via...

Q2. La méthode d'estimation historique de NONMEM est...

Exercices d'entraînement

Activités guidées

Cas en plusieurs étapes combinant calcul, interprétation et raisonnement.

Activité guidée · 10 min · Niveau 1

Préparer un ajustement NONMEM

Calcul · InterprétationÀ commencer

Citer cette page

Berrah R. NONMEM — l'ancêtre. PMx Explain, 2026. https://rberrah.github.io/pharmacometrie/chapitres/tools-nonmem/

@misc{berrah2026toolsnonmem,
  author       = {Berrah, Racym},
  title        = {{NONMEM — l'ancêtre}},
  howpublished = {PMx Explain},
  year         = {2026},
  url          = {https://rberrah.github.io/pharmacometrie/chapitres/tools-nonmem/},
  note         = {Texte actuel sous licence CC BY-NC-SA 4.0}
}