Soumission GitHub
Le contributeur ouvre une issue structurée avec le modèle, sa référence, les covariables et les limites.
Suivi thérapeutique pharmacologique
Sélectionnez un modèle PopPK, renseignez les administrations, concentrations et covariables, puis estimez les paramètres individuels et comparez les schémas de dose dans le moteur R. Plusieurs modèles peuvent être combinés par pondération AIC ou vraisemblance.
Le calcul s'exécute dans une application Shiny séparée avec mrgsolve et mapbayr. L'application est conçue pour ne pas persister les données patient ni les modèles personnels au-delà de la session de calcul ; ils ne sont pas ajoutés au dépôt ni aux statistiques d'audience. Les journaux techniques et mécanismes d'hébergement de Shiny suivent des politiques distinctes.
Moteur pharmacométrique
Contribution
Le contributeur ouvre une issue structurée avec le modèle, sa référence, les covariables et les limites.
Le fichier est relu avant intégration : unités, compartiments, variabilité, erreur résiduelle et article source.
Une pull request ou une action GitHub ajoute le modèle à la bibliothèque statique, puis le site se redéploie.
Modèles pharmacométriques publiés
Adultes en réanimation, ventilation mécanique, pneumonie associée à la ventilation.
Voie d'administration : IV intermittente
Le modèle reprend la structure de base du tableau 2 et non le modèle final incluant les covariables. Usage limité à la simulation.
Adultes recevant une amiodarone orale au long cours pour arythmie cardiaque.
Voie d'administration : Orale
Adaptation pour la simulation des interactions médicamenteuses (DDI). Les paramètres publiés CL/F, Q/F, V1/F et V2/F sont repris, mais l'absorption et l'erreur résiduelle restent des hypothèses. Texte intégral non disponible pour vérifier ces éléments.
Adultes en état critique hospitalisés en réanimation.
Voie d'administration : IV intermittente
Adultes gravement brûlés hospitalisés en réanimation.
Voie d'administration : IV intermittente
Fournier A et al. Antimicrob Agents Chemother. 2018;62:e00505-18.
DOI 10.1128/AAC.00505-18L'équation publiée de clairance étant ambiguë, l'effet de la fonction rénale a été recentré. Seule la variabilité interindividuelle de CL est conservée.
Adultes obèses recevant de l'amoxicilline/acide clavulanique IV ou oral.
Voie d'administration : IV intermittente · Orale
La chaîne d'absorption orale par transit a été reconstruite, car l'article ne fournit pas toutes ses équations exécutables.
Adultes traités pour une endocardite infectieuse.
Voie d'administration : IV continue
Le prior original est non paramétrique (NPAG) ; le moteur utilise une approximation log-normale pour les simulations et l'interface MAP.
Enfants opérés en chirurgie cardiaque avec circulation extracorporelle.
Voie d'administration : IV intermittente
Cheng V et al. Anaesth Crit Care Pain Med. 2026;45:101653.
DOI 10.1016/j.accpm.2025.101653L'effet péri-/postopératoire est pris en compte mais la variabilité interoccasion (IOV) publiée est omise.
Adultes de 24 à 91 ans opérés d'une arthroplastie totale de hanche.
Voie d'administration : IV intermittente
Patients chirurgicaux pédiatriques, principalement 10-12 ans, avec comparaison adulte.
Voie d'administration : IV intermittente
Schmitz ML et al. Antimicrob Agents Chemother. 2015;59:4173-4180.
DOI 10.1128/AAC.00082-15La variabilité interoccasion sur CL et V1 n'est pas représentée. La forme de l'erreur combinée diffère de celle de l'article.
Adultes en état critique hospitalisés en réanimation.
Voie d'administration : IV intermittente
Adultes en réanimation, incluant insuffisance rénale et hémodialyse intermittente.
Voie d'administration : IV intermittente
Jonckheere S et al. J Antimicrob Chemother. 2016;71:2538-2546.
DOI 10.1093/jac/dkw171Adultes en état critique avec pneumonie nosocomiale ou associée à la ventilation.
Voie d'administration : IV intermittente
Adultes au début de la période suivant une transplantation rénale.
Voie d'administration : Orale
Adaptation pour les DDI : fraction CYP3A ajoutée uniquement à la simulation d'interaction. Variabilité interoccasion de la biodisponibilité F omise.
Adultes sains inclus dans une étude pharmacocinétique de recherche de dose.
Voie d'administration : Orale
Adaptation pour les DDI à partir d'une étude NCA, et non d'un modèle PopPK publié. CL/F et Vz/F concernent 50 mg à l'état stationnaire ; ka et effets aléatoires sont supposés. Vérification limitée aux sources disponibles.
Adultes sains et adultes infectés issus d'essais cliniques regroupés.
Voie d'administration : IV intermittente
Dvorchik BH et al. Antimicrob Agents Chemother. 2004;48:2799-2807.
DOI 10.1128/AAC.48.8.2799-2807.2004Adultes traités pour une infection ostéo-articulaire.
Voie d'administration : IV intermittente
Adultes sains après diltiazem oral et intraveineux.
Voie d'administration : Orale
Adaptation pour les DDI : disposition IV biphasique simplifiée en un compartiment et absorption supposée. La source complète reste à vérifier.
Adultes sains dans des études d'absorption et de biodisponibilité orale.
Voie d'administration : Orale
Mather LE et al. Br J Clin Pharmacol. 1981;12:131-140.
DOI 10.1111/j.1365-2125.1981.tb01191.xAdaptation pour les DDI à partir d'une étude de biodisponibilité influencée par les repas et la formulation ; CL, V et ka sont des hypothèses de simulation.
Adultes transplantés rénaux sous schéma sans inhibiteur de calcineurine.
Voie d'administration : Orale
Moes DJAR et al. Clin Pharmacokinet. 2012;51:467-480.
DOI 10.2165/11599710-000000000-00000Adaptation pour les DDI : effet dose–CL lié au suivi thérapeutique omis, variabilités de Q/V2 ajoutées et fraction CYP3A dédiée aux interactions. La source primaire intégrale reste à vérifier.
Adultes: cancers métastatiques thyroïdiens ou mammaires et transplantés rénaux.
Voie d'administration : Orale
Adaptation pour les DDI : volume du foie approximé, variabilité interoccasion de MAT représentée comme interindividuelle et fraction non-CYP ajoutée pour les interactions.
Adultes issus des études de pharmacocinétique clinique synthétisées dans la revue.
Voie d'administration : Orale
Debruyne D, Ryckelynck JP. Clin Pharmacokinet. 1993;24:10-27.
DOI 10.2165/00003088-199324010-00002Adaptation pour les DDI à partir d'une revue de PK clinique, et non d'un modèle PopPK. CL, F et demi-vie sont documentés ; ka et variabilité sont supposés. Vérification limitée.
Adultes, majoritairement âgés, sous hémodialyse chronique.
Voie d'administration : IV intermittente
Franck B et al. Eur J Clin Pharmacol. 2020;76:947-955.
DOI 10.1007/s00228-020-02867-3L'article ne précise pas clairement si le volume utilise le poids maigre ou total ; le modèle retient le poids total.
Adultes traités pour une endocardite infectieuse, hors dialyse.
Voie d'administration : IV intermittente
Les définitions exactes du poids maigre corrigé et de la variante Cockcroft–Gault n'étant pas disponibles, leur implémentation est explicitement choisie.
Adultes en réanimation, incluant hypoalbuminémie et certains patients sous épuration continue.
Voie d'administration : IV intermittente
Hodiamont CJ et al. Int J Antimicrob Agents. 2017;49:204-211.
DOI 10.1016/j.ijantimicag.2016.10.022Le moteur utilise une estimation Cockcroft–Gault, limite les valeurs d'albumine et applique des hypothèses allométriques sur Q et V2 non précisées par l'article.
Adultes atteints de cancer; variante utilisant la clairance de la créatinine.
Voie d'administration : IV intermittente
Rosario MC et al. Br J Clin Pharmacol. 1998;46:229-236.
DOI 10.1046/j.1365-2125.1998.00779.xLes formules des covariables ont été reconstruites à partir des variables disponibles. Covariance et variabilité de V1 non documentées.
Adultes atteints de cancer; variante à covariables cliniques.
Voie d'administration : IV intermittente
Rosario MC et al. Br J Clin Pharmacol. 1998;46:229-236.
DOI 10.1046/j.1365-2125.1998.00779.xLes formules cliniques ont été reconstruites à partir des covariables accessibles ; covariance et variabilité de V1 non documentées.
Adultes sains et adultes avec infection fongique invasive, essais de phase 1 et SECURE.
Voie d'administration : Orale
Desai A et al. Antimicrob Agents Chemother. 2016;60:5483-5491.
DOI 10.1128/AAC.02819-15Adaptation pour les DDI : les effets race, statut patient et BMI sont retenus, mais une seule branche de variabilité et d'erreur résiduelle est appliquée par défaut.
Adultes sains inclus dans des études contrôlées d'interactions médicamenteuses.
Voie d'administration : Orale
Adaptation pour les DDI à partir d'une étude NCA ; profil moyen approximé et non PopPK publié. Vérification limitée aux sources accessibles.
Adultes traités pour une infection ostéo-articulaire.
Voie d'administration : Orale
Adultes opérés d'une arthroplastie élective de hanche ou de genou.
Voie d'administration : IV intermittente
Le compartiment osseux irréversible est omis afin de simuler la PK plasmatique à doses répétées ; l'erreur résiduelle est approximée.
Adultes en réanimation, sepsis sévère ou choc septique, ventilés.
Voie d'administration : IV intermittente
Buerger C et al. Antimicrob Agents Chemother. 2006;50:2455-2463.
DOI 10.1128/AAC.01468-05Les données sources proviennent d'une analyse PK individuelle ; l'interprétation du modèle comme prior populationnel est une approximation.
Adultes japonais hospitalisés pour infection.
Voie d'administration : IV intermittente · Orale
Sasaki T et al. Antimicrob Agents Chemother. 2011;55:1867-1873.
DOI 10.1128/AAC.01185-10La biodisponibilité orale et le coefficient sexe de Cockcroft–Gault sont des hypothèses d'implémentation ; le modèle PD plaquettaire n'est pas inclus.
Adultes sains et patients adultes sous suspension orale de posaconazole en prophylaxie ou traitement.
Voie d'administration : Orale
Dolton MJ et al. Antimicrob Agents Chemother. 2014;58:6879-6885.
DOI 10.1128/AAC.03777-14Adaptation pour les DDI : la structure avec temps de latence et les covariables sont reprises, mais les variabilités et erreurs d'une branche de l'étude sont utilisées par défaut.
54 adultes sud-coréens avec tuberculose pulmonaire, dont 21 avec diabète.
Voie d'administration : Orale
L'équation imprimée pour l'effet du BMI sur CL est ambiguë (opérateur manquant devant 6,22). L'interprétation retenue est signalée.
100 adultes tanzaniens avec tuberculose pulmonaire, avec ou sans VIH.
Voie d'administration : Orale
Jeremiah K et al. Antimicrob Agents Chemother. 2014;58:3468-3474.
DOI 10.1128/AAC.02307-13Les covariables VIH, supplémentation nutritionnelle et phase de traitement, la variabilité interoccasion et plusieurs effets aléatoires publiés sont omis.
54 adultes chinois traités par rifampicine orale pour une tuberculose pulmonaire.
Voie d'administration : Orale
Adultes atteints de tuberculose pulmonaire après rifampicine orale et intraveineuse en administration chronique.
Voie d'administration : Orale
Adaptation pour les DDI : clairance et biodisponibilité publiées reprises, mais V et ka absents du résumé et supposés pour la simulation. Texte intégral non vérifié.
Adultes traités pour une infection ostéo-articulaire, avec ou sans acide fusidique.
Voie d'administration : Orale
Ambiguïté sur le modèle résiduel : erreur additive interprétée comme écart-type puis convertie en variance, tandis que l'article évoque aussi une analyse logarithmique.
Adultes vivant avec le VIH-1, ritonavir utilisé comme booster ou antiviral.
Voie d'administration : Orale
Kappelhoff BS et al. Br J Clin Pharmacol. 2005;59:174-182.
DOI 10.1111/j.1365-2125.2004.02241.xAdaptation pour les DDI : effets fixes et temps de latence repris ; IOV sur F, covariance V–ka et mélange de deux erreurs résiduelles omis.
Adultes transplantés rénaux sous sirolimus et mycophénolate, sans inhibiteur de calcineurine.
Voie d'administration : Orale
Djebli N et al. Clin Pharmacokinet. 2006;45:1135-1148.
DOI 10.2165/00003088-200645110-00007Adaptation pour les DDI : certaines variances ne sont pas documentées et la fraction non-CYP est une hypothèse d'interaction. Vérification limitée au résumé de la source.
Adultes transplantés rénaux âgés de 65 ans ou plus recevant tacrolimus Envarsus.
Voie d'administration : Orale
Adaptation pour les DDI : allométrie et absorption conservées mais IOV de CL et changement de l'erreur résiduelle selon les prélèvements omis ; décomposition CYP supplémentaire.
Adultes transplantés rénaux recevant Prograf ou Advagraf.
Voie d'administration : Orale
Woillard JB et al. Br J Clin Pharmacol. 2011;71:391-402.
DOI 10.1111/j.1365-2125.2010.03837.xAdaptation pour les DDI : la PK de base publiée (Prograf/Advagraf) est conservée ; la clairance est décomposée en fractions sensibles et non sensibles aux interactions sans changer la clairance initiale.
Adultes hospitalisés avec ou sans hémodialyse.
Voie d'administration : IV intermittente
Adultes en réanimation recevant la vancomycine IV intermittente ou continue; modèle fondé sur l'âge, la fonction rénale et le poids.
Voie d'administration : IV intermittente · IV continue
Revilla N et al. Br J Clin Pharmacol. 2010;70:201-212.
DOI 10.1111/j.1365-2125.2010.03679.xAdultes septiques en réanimation recevant la vancomycine en perfusion continue.
Voie d'administration : IV continue
Roberts JA et al. Antimicrob Agents Chemother. 2011;55:2704-2709.
DOI 10.1128/AAC.01708-10Adultes traités par voriconazole; modèle non linéaire intégrant la CRP.
Voie d'administration : Orale
van den Born D et al. Int J Antimicrob Agents. 2023;61:106750.
DOI 10.1016/j.ijantimicag.2023.106750Adaptation pour les DDI : seuls les effets aléatoires de Vmax sont conservés et le modèle d'erreur résiduelle est un prior de simulation adapté.
Application inspirée de TDMx. Les résultats ne constituent pas une recommandation clinique et exigent une validation locale des modèles. L'application est conçue pour ne pas persister les dossiers patient ni les modèles collés au-delà de la session de calcul.