Deux variables qualitatives
Le χ² d'indépendance et le tableau de contingence
Tester le lien entre deux caractères qualitatifs : effectifs attendus sous indépendance et degrés de liberté du tableau croisé.
01 · Croiser deux caractères qualitatifs
Le χ² d'ajustement comparait une répartition à une théorie connue d'avance. Mais la question la plus courante en biologie est autre : deux caractères qualitatifs sont-ils liés ?
Exemple. On soupçonne que le taux d'infection nosocomiale dépend du centre hospitalier. On dispose de trois centres, chacun avec 200 patients suivis :
| Centre | Infection : oui | Infection : non | Total |
|---|---|---|---|
| Centre 1 | 20 | 180 | 200 |
| Centre 2 | 30 | 170 | 200 |
| Centre 3 | 40 | 160 | 200 |
| Total | 90 | 510 | 600 |
Ce tableau croisé s'appelle un tableau de contingence. Les taux d'infection observés sont 10 %, 15 % et 20 % : ils semblent croître. Mais ces écarts sont-ils réels, ou de simples fluctuations ? Ici, aucune répartition théorique n'est donnée : elle devra être construite à partir des données.
02 · Les effectifs attendus sous indépendance
L'hypothèse nulle est l'indépendance : le taux d'infection est le même partout, et seul le hasard crée les différences entre centres.
Sous cette hypothèse, le taux commun est le taux global : . Si chaque centre suivait ce taux, on attendrait, pour ses 200 patients, infections. On généralise par la règle du produit des marges :
Par exemple, pour la case « Centre 1 / oui » : . Le tableau des effectifs attendus devient :
| Centre | Oui (attendu) | Non (attendu) |
|---|---|---|
| Centre 1 | 30 | 170 |
| Centre 2 | 30 | 170 |
| Centre 3 | 30 | 170 |
L'écart entre observé et attendu saute aux yeux : le centre 1 compte 20 infections là où l'indépendance en prévoit 30 ; le centre 3 en compte 40.
03 · Calcul du χ² et degrés de liberté
On applique la même formule qu'au chapitre précédent, sur les six cases :
Les degrés de liberté d'un tableau de contingence dépendent de sa forme. Une fois les totaux (marges) fixés, seules lignes et colonnes sont libres :
04 · Conclusion
Pour 2 degrés de liberté, le seuil de la table à 5 % est 5,99. Notre le dépasse : on rejette l'indépendance (degré de signification ).
Autrement dit, le taux d'infection dépend du centre : les différences entre 10 %, 15 % et 20 % sont trop marquées pour n'être que du bruit.
05 · Le χ² d'indépendance est un test global
La démarche est identique quelle que soit la taille du tableau : construire les attendus par le produit des marges, sommer les , et comparer au seuil pour degrés de liberté. Le prochain chapitre examine le cas le plus courant et le plus simple : le tableau 2 × 2.
06 · À retenir
- Un tableau de contingence croise deux caractères qualitatifs ; est leur indépendance.
- Effectif attendu d'une case : (produit des marges).
- On calcule sur toutes les cases.
- Degrés de liberté : ; on compare au seuil de la table (5,99 pour 2 ddl).
- Un χ² significatif prouve une association, pas une causalité ; c'est un test global qu'il faut ensuite localiser via les contributions.
QCM · épreuve 1
QCM
Q1. Dans un tableau de contingence, l'effectif attendu d'une case sous l'hypothèse d'indépendance vaut :
Q2. Pour un tableau à l lignes et c colonnes, le nombre de degrés de liberté est :
Q3. Un χ² d'indépendance significatif signifie que :